根据总规，景区先后编制完成了“武夷宫小区详细规划”、“星村镇总体规划”、“武夷山风景名胜区闽越王城景区规划”等若干详细性规划和控制性规划。在景区规划建设管理上，景区始终坚持“规划在先，建设在后”的原则。将规划与建设职能分离，引进ISO14001环境管理体系，制定了一系列针对景区环境监测、管理评审、应急响应、固体废弃物管理程序、风景资源管理程序、内部审核控制程序、景区水环境质量管理办法、景区植物资源监测方法、景区建设监督管理办法、项目审批程序、景区环境保护违法、违规、违章行为及案件处理规程等事前审核、报批管理流程，并设立景区世界遗产保护局作为具体经办部门，有力地强化了景区的管理保护力度。
科学处理景区经营与周边村山林权属矛盾 武夷山主景区林地面积77644.7亩，2000年全部划为生态公益林，林地中集体林面积占99.6%。2005年，景区按照《中央关于集体林权改革意见》、《风景名胜区条例》、《福建省世界文化与自然遗产保护条例》等有关精神和有关法律、法规的规定，成功完成了景区核心区“山林两权分离”，即，“山林所有权归村集体，使用管理权归景区，实行有偿使用”。补偿金以2006年为基数，随着风景区门票收入增长而提高。到目前为止，景区7个行政村77644.7亩公益林全部签订了协议，不但解决了风景区发展的瓶颈，而且从根本上保障了景区村民的利益。形成了“资源共享、效益同步、发展和谐”的良好态势。通过实行“两权分离”管理的办法，不仅很好地落实了《物权法》、《风景名胜区条例》等法律法规和中央关于集体林权制度改革的精神，同时化解了与景区村民的矛盾，维护了广大群众的利益，增加了农民的收入，形成了发展合力，推动了景区的发展。
严肃依法处理破坏景区资源的行为 武夷山景区在妥善处理好景区内、景区周边村各种利益矛盾的同时，针对一些严重影响景区发展的特殊矛盾，依据《风景名胜区条例》、《福建省武夷山世界文化与自然遗产保护管理条例》、《福建省武夷山风景区保护管理办法》等法规，成立了世界遗产保护局，强化景区规划前置审批与环境整治力度。进一步加大对主景区违章建筑物的整治，对与环境不相协调的，违法违规乱搭、乱建、乱盖的，坚决予以拆除，确保了景区科学、有效、协调的保护与管理。
